A．E在1号染色体上，F在2号染色体上
B．均在2号染色体上
C．均在3号染色体上
D．E在3号染色体上，F在4号染色体上
【解析】 若E在1号染色体上，F在2号染色体上，则基因型为AaEF的短纤维抗虫棉植株自交，产生的配子类型有两种：AEaF＝11，后代基因型为1AAEE、2AaEF、1aaFF，表现型为短纤维不抗虫短纤维抗虫长纤维不抗虫＝121，A不符合题意；若E、F基因均在2号染色体上，则基因型为AaEF的短纤维抗虫棉植株自交，产生的配子类型有两种：AaEF＝11，后代基因型为1AA、2AaEF、1aaEEFF，表现型为短纤维不抗虫短纤维抗虫长纤维抗虫＝121，B不符合题意；若E、F基因均在3号染色体上，则基因型为AaEF的短纤维抗虫棉植株自交，产生的配子类型有两种：AaEFaAEF＝1111，后代表现型为：短纤维抗虫短纤维不抗虫长纤维抗虫长纤维不抗虫＝9331，C符合题意；若E在3号染色体上，F在4号染色体上，则基因型为AaEF的短纤维抗虫棉植株自交，产生的配子类型有两种：AEaFaEAF＝1111，后代表现型为：短纤维抗虫短纤维不抗虫长纤维抗虫长纤维不抗虫＝5722，D不符合题意。
2．(2021·新高考8省联考·辽宁卷)杜洛克大红猪皮毛颜色由常染色体上两对独立遗传的基因(R、r和T、t)控制。基因R或T单独存在的个体，能将无色色素原转化为沙色色素；基因r、t不能转化无色色
