1．蛋白质中游离的氨基和羧基的计算
(1)蛋白质中游离的氨基和羧基存在的位置：位于蛋白质中多肽链的两端、氨基酸的R基中。
(2)计算公式：蛋白质中游离的氨基(羧基)数＝肽链数＋R基中的氨基(羧基)数。
注：若为环状肽，游离的氨基或羧基＝R基中的氨基或羧基数。
2．蛋白质中肽键数、脱去水分子数的计算
肽键数＝脱去水分子数＝氨基酸总数－肽链数。
注：若为环状肽，肽键数＝脱去水分子数＝氨基酸数。
3．蛋白质中含有N、O原子数的计算
(1)N原子数＝肽键数＋肽链数＋R基上的N原子数＝各氨基酸中的N原子总数。
(2)O原子数＝肽键数＋2×肽链数＋R基上的O原子数＝各氨基酸中的O原子总数－脱去水分子数
4．蛋白质的相对分子质量的计算
(1)氨基酸形成蛋白质的过程中，导致相对分子质量变化的原因
①形成肽键时，每形成一个肽键就脱去一分子的水，相对分子质量就减少18。
②若形成二硫键，每形成一个二硫键就脱去两个H，相对分子质量就减少2。
(2)计算公式：蛋白质的相对分子质量＝所有氨基酸的相对分子质量之和－18×脱去的水分子数－2×二硫键数。
注：若不涉及二硫键，则公式中不需减去“2×二硫键数”。
